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 | Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Las Brujas. Por información adicional contacte bibliolb@inia.org.uy. |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
26/04/2023 |
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Actualizado : |
19/06/2023 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
REBOLLO, I.; SCHEFFEL, S.; BLANCO, P.H.; MOLINA, F.; MARTÍNEZ, S.; CARRACELAS, G.; AGUILAR, I.; PÉREZ DE VIDA, F.; ROSAS, J.E. |
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Afiliación : |
MARÍA INÉS REBOLLO PANUNCIO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Department of Statistics, College of Agriculture, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; SHEILA SCHEFFEL, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Department of Statistics, College of Agriculture, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; PEDRO HORACIO BLANCO BARRAL, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FEDERICO MOLINA CASELLA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SEBASTIÁN MARTÍNEZ KOPP, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JULIO GONZALO CARRACELAS GARRIDO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BLAS PEREZ DE VIDA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JUAN EDUARDO ROSAS CAISSIOLS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Department of Statistics, College of Agriculture, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay. |
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Título : |
Consolidating twenty-three years of historical data from an irrigated subtropical rice breeding program in Uruguay. |
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Fecha de publicación : |
2023 |
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Fuente / Imprenta : |
Crop Science, 2023. https://doi.org/10.1002/csc2.20955 - [Article in Press]. |
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ISSN : |
1435-0653 |
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DOI : |
10.1002/csc2.20955 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: First published 15 March 2023. -- Corresponding author: jrosas@inia.org.uy -- |
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Contenido : |
Breeding programs generate vast amount of data which are often scattered in separate files. This hinders the application of modern breeding tools such as multi-environment analyses and genomic selection. This research work describes the process of consolidating 23 years of phenotypic, pedigree, and genomic records from the Uruguayan national rice (Oryza sativa L.) breeding program, and the features and structure of the resulting database. Using a custom-made R code, we gathered all the available data from 1997 to 2020 corresponding to field trials, blast disease evaluation nurseries, laboratory analyses of milling and cooking quality, pedigree information, and genomic information for selected advanced breeding lines, and organized it into a relational database. Records of 996 trials in 12 locations over a span of 23 years, 91,636 field plots with information on 14 phenotypic variables, pedigree for 19,447 genotypes, and genomic information regarding 61,260 single nucleotide polymorphism (SNP) markers for 965 genotypes were recovered. The dataset is structured in trials, phenotypes, lines, genomic information, and SNP tables in an easy-to-access relational database, which will be a valuable resource for rice breeding. © 2023 American Society of Agronomy, Crop Science Society of America, and Soil Science Society of America |
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Palabras claves : |
Breeding program; Breeding trials; Phenotypic data. |
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Thesagro : |
ORYZA SATIVA L. |
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Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
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Marc : |
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001 1064059
005 2023-06-19
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500 $aArticle history: First published 15 March 2023. -- Corresponding author: jrosas@inia.org.uy --
520 $aBreeding programs generate vast amount of data which are often scattered in separate files. This hinders the application of modern breeding tools such as multi-environment analyses and genomic selection. This research work describes the process of consolidating 23 years of phenotypic, pedigree, and genomic records from the Uruguayan national rice (Oryza sativa L.) breeding program, and the features and structure of the resulting database. Using a custom-made R code, we gathered all the available data from 1997 to 2020 corresponding to field trials, blast disease evaluation nurseries, laboratory analyses of milling and cooking quality, pedigree information, and genomic information for selected advanced breeding lines, and organized it into a relational database. Records of 996 trials in 12 locations over a span of 23 years, 91,636 field plots with information on 14 phenotypic variables, pedigree for 19,447 genotypes, and genomic information regarding 61,260 single nucleotide polymorphism (SNP) markers for 965 genotypes were recovered. The dataset is structured in trials, phenotypes, lines, genomic information, and SNP tables in an easy-to-access relational database, which will be a valuable resource for rice breeding. © 2023 American Society of Agronomy, Crop Science Society of America, and Soil Science Society of America
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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| Registros recuperados : 64 | |
| 48. |  | GRASSO, R.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; DOCAMPO, R.; GHELFI, J.; MALAQUINA, F.; VICENTE, E. Caracterización físico química de sustratos y utilización de distintas fuentes de fertilización de plantas madres para viveros de frutilla del cultivar YURÍ. [70. Tecnología del Cultivo] In: ASAHO (ASOCIACIÓN ARGENTINA DE HORTICULTURA); CONGRESO ARGENTINO DE HORTICULTURA, 38. BAHÍA BLANCA, BS.AS. (ARGENTINA), 5 AL 8 DE OCTUBRE 2015. Resúmenes de trabajo Horticultura. Buenos Aires: ASAHO, 2015. p.71 [Abstract-Resúmen]| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 49. | | GARCIA, C.; VILARO, F.; DOCAMPO, R.; CASANOVA, S.; CARLESSO, R.; REINERI, M.; BURGOS, W. Cultivo de papa: manejo del riego en el sur del país Revista INIA, 2005, no. 2, p. 26-29| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 50. | | Rabuffetti, A.; García, C.; Docampo, R.; Casanova, S.; Moura, M.; Esmolark, C.; García, M.; Díaz, S. Efecto de diferentes niveles de fertilización nitrogenada mineral y de estiércol de ave en el rendimiento de maíz bajo riego Las Brujas, Canelones (Uruguay): INIA, 2008. p.30 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 528)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 51. | | LEONI, C.; SORIA, J.; PEREIRA, G.; PICOS, C.; GARCIA, C.; DOCAMPO, R.; CASTILLO, A.; CARRAU, F. Fruticultura: una opción de diversificación para la región noreste del Uruguay?: arándanos ln: Bemhaja, M.; Pittaluga, O., eds. 30 años de investigación en suelos de areniscas, INIA Tacuarembó. Montevideo (Uruguay): INIA, 2006. p. 293-300 (INIA Serie Técnica ; 159)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 52. | | LEONI, C.; SORIA, J.; PEREIRA, G.; PICOS, C.; GARCIA, C.; DOCAMPO, R.; CABRERA, D.; CARRAU, F. Fruticultura: una opción de diversificación para la región noreste del Uruguay?: durazneros y nectarinos. ln: Bemhaja, M.; Pittaluga, O., eds. 30 años de investigación en suelos de areniscas, INIA Tacuarembó. Montevideo (Uruguay): INIA, 2006. p. 287-291 (INIA Serie Técnica ; 159)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 53. | | Rabuffetti, A.; García, C.; Docampo, R.; Casanova, S.; Moura, M.; Esmolark, C.; García, M.; Díaz, S. Evaluación agronómica y ambiental del estiércol de ave como fuente de N en sistemas de producción intensiva bajo riego Las Brujas, Canelones (Uruguay): INIA, 2008. p.25-28 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 528)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 56. | | Rabuffetti, A.; García, C.; Docampo, R.; Casanova, S.; Moura, M.; Esmolark, C.; García, M.; Díaz, S. Manejo de la papa var. Chieftain en la secuencia 1 Las Brujas, Canelones (Uruguay): INIA, 2008. p.29 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 528)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 59. | | PEREIRA, G.; LEONI, C.; LAVALLEJA CASTRO, J.; GARCIA, C.; DOCAMPO, R. Manejo de suelos arenosos del noreste para la producción de papa ln: Bemhaja, M.; Pittaluga, O., eds. 30 años de investigación en suelos de areniscas, INIA Tacuarembó. Montevideo (Uruguay): INIA, 2006. p. 259-264 (INIA Serie Técnica ; 159)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 60. | | CASTILLO, A.; MONTAÑEZ MASSA, A.; DOCAMPO, R.; RODRIGUEZ, P.; CABRERA, D.; ZOPPOLO, R. Micorrización de portainjertos de manzano micropropagados. [Mycorrhization of micropropagated apple rootstocks.] Cultivos Tropicales, 2016, v. 37, Supl. 1, p. 7-12. 1819-4087 NÚMERO ESPECIAL. Este número de la revista está dedicado al X Congreso Internacional de Biotecnología Vegetal (BioVeg2015). Article history: Recibido: 15 de mayo de 2015;
Aceptado: 3 de diciembre de 2015| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : B - 3 |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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